痰涂片做革兰染色，对肺部感染诊断很有意义。如发现大量葡萄球菌、肺炎双球菌、革兰阴性细菌，是抗生素治疗的指征；发现抗酸杆菌，在未获得培养结果前，就可做抗结核治疗。由于痰液中混入的杂菌较多，检获细菌不一定与疾病有关，判断病原菌意义常以优势细菌为依据，但须做细菌培养鉴定。